L'épigénétique d'empreinte est définie par l'héritage d'étiquettes épigénétiques de génération cellulaire en génération cellulaire et des parents à leur progéniture.
Les étiquettes épigénétiques sur les gènes imprimés restent généralement en place pendant toute la vie de l'organisme. Mais ils sont réinitialisés lors de la formation des ovules et des spermatozoïdes. Qu'ils proviennent de maman ou de papa, certains gènes sont toujours inhibés dans l'ovule et d'autres sont toujours inhibés dans le sperme.