Veena Garg
Objectif - Cette étude vise à décrire l'utilisation de méthodes de calcul in silico comme outils émergents importants dans la conception et l'étude d'expériences de biodégradation des pesticides.
Méthode - EAWAG-BBD PPS et la base de données eMolecules ont été utilisés pour prédire les voies de biodégradation du 1-naphtyl-N-méthyl carbamate, communément appelé carbaryl. La pertinence des résultats a été étudiée en comparant la voie obtenue avec les produits issus des expériences de biodégradation.
Résultats - La voie générée est de nature aérobie et confirme la décomposition du carbaryl en 1-naphtol comme produit de dégradation majeur avec libération de méthylamine, ce qui a été prouvé par plusieurs études. Le clivage du cycle du 1-naphtol est le problème majeur car il se produit beaucoup plus tard dans la voie. La voie obtenue élucide que certains des composés, à savoir le 1, 2-dihydroxynaphtalène, le salicylate, le catéchol, le gentisate, le succinate et le maléylacétate, ont été signalés par diverses études. De plus, la voie plausible mentionne également le 2-oxopropanoate, le (2Z, 4Z)-hexa-2, 4-diènedioate ou le 2-oxo-pent-4-énoate, le 1, 2, 4-benzènetriol, le (Z)-4, 6-dioxohept-2-ènedioate, comme produits intermédiaires, qui doivent encore être prouvés par des expériences de biodégradation.
Conclusion - Ainsi, l'EAWAG-BBD PPS peut être utilisé pour concevoir et étudier des expériences de biodégradation/bioremédiation.