Journal des biomarqueurs Libre accès

Abstrait

Augmentation des mutations somatiques grâce au séquençage de nouvelle génération (NGS) à large panel dans les tumeurs MMR déficientes (dMMR) : un rapport de cas illustratif

Steven Sorscher

Le séquençage de nouvelle génération (NGS) à large panel de tumeurs ou d'ADN circulant libre (cf) est couramment utilisé lorsque la progression du cancer survient après des thérapies standard. Ce séquençage de nouvelle génération est effectué afin d'évaluer la tumeur pour détecter la présence d'altérations génomiques somatiques dans un ou plusieurs des centaines de gènes dans l'espoir d'identifier une anomalie moléculaire ciblable ou exploitable.

Pour le cancer colorectal, il est recommandé de tester systématiquement la déficience tumorale de l'expression de l'un des nombreux gènes de réparation des mésappariements (dMMR) dans presque tous les cas et cela se fait généralement par immunohistochimie (IHC). Récemment, la FDA a accordé une approbation accélérée pour l'utilisation d'inhibiteurs de point de contrôle dans toutes les tumeurs solides démontrant une dMMR et des tests de routine pour l'expression de MMR dans les cancers non colorectaux sont donc prévus. De plus, les tumeurs dMMR présentent généralement plus de mutations somatiques potentiellement exploitables que celles observées pour les tumeurs MMR compétentes (pMMR), lorsque le NGS du tissu tumoral ou de l'ADN cf circulant est effectué.

Nous décrivons ici le cas d'un patient atteint du syndrome de Lynch dont le cancer du côlon présentait 70 altérations somatiques. Après une réponse prolongée au traitement par inhibiteur de PD1, une biopsie liquide a de nouveau montré de nombreuses mutations dans l'ADN circulant de la tumeur. La fréquence allélique de mutation BRCA2 (MAF) très élevée rapportée suggère un bénéfice potentiel du traitement par inhibiteur de PARP chez ce patient.

Ce cas montre que, dans la mesure où les patients atteints de tumeurs dMMR présentent de manière caractéristique de nombreuses mutations actuellement identifiées par NGS, les patients atteints de tumeurs dMMR (ou MSI-H) pourraient particulièrement bénéficier du NGS de leurs tumeurs afin d'identifier les anomalies moléculaires exploitables qui pourraient répondre à une thérapie hautement ciblée. Étant donné que les patients atteints de tumeurs dMMR vivent plus longtemps grâce à l'utilisation d'un traitement par inhibiteur de point de contrôle, on peut également s'attendre à ce que le NGS en temps réel de leurs tumeurs puisse identifier les anomalies moléculaires exploitables acquises pendant la période où ils reçoivent l'inhibiteur de point de contrôle.