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Abstrait

Détection précoce du cancer colorectal grâce à la technologie XNA

Michael J Powell

Les scientifiques de DiaCarta ont développé une technologie innovante de pince moléculaire à acide xénonucléique, ou technologie XNA, pour répondre aux besoins de sensibilité pour la mutation des gènes tumoraux et d'autres mutations génétiques importantes dans les échantillons de biopsie liquide et FFPE. La technologie XNA utilise des oligomères XNA de conception exclusive avec des squelettes modifiés qui hybrident les séquences d'ADN cibles d'intérêt par appariement de bases Watson-Crick. Lorsque la séquence est parfaitement correspondante, les XNA s'hybrident étroitement aux séquences cibles d'ADN, bloquant l'élongation du brin par l'ADN polymérase dans la réaction de PCR. Cependant, lorsqu'une mutation est présente dans la séquence cible, l'inadéquation conduit à l'instabilité du duplex oligomère XNA:ADN, permettant l'élongation du brin par l'ADN polymérase. En conséquence, seule la séquence cible contenant des mutations est sélectionnée pour l'amplification et la séquence de type sauvage, bien qu'elle soit présente dans des quantités/copies d'ADN beaucoup plus importantes, ne sera pas amplifiée. Étant donné que les oligomères XNA ne sont pas reconnus par les ADN polymérases, ils ne peuvent pas servir d'amorces dans les réactions de PCR en temps réel ultérieures. Les tests de pinces moléculaires XNA sont très sensibles et utilisent des acides nucléiques obtenus à partir d'échantillons de biopsie liquide ou de biopsie de tissu tumoral (FFPE). La limite de détection (LOD) peut atteindre jusqu'à 0,5 % (7 ou 8 copies d'ADN mutant) dans 5 ng d'ADNct, soit environ l'équivalent de 2 ml de sang d'un patient. Étant donné que la présence de niveaux élevés d'ADN tumoral mutant libre de cellules circulantes (ADNct) et d'acides nucléiques dérivés d'exosomes s'est avérée être associée à une faible survie dans le cancer colorectal et d'autres cancers, la surveillance dynamique du niveau peut être utilisée comme facteur prédictif du traitement du cancer.