Journal du VIH et du virus rétro Libre accès

Abstrait

Comparaison de la caractérisation bactériologique, biochimique et moléculaire entre Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline et sensible à la méthicilline parmi les isolats cliniques d'enfants de moins de 5 ans souffrant de pneumonie et/ou d'infection des voies respiratoires inférieures en Malaisie

Rayhan Ahmed1; Md. Mehedi Hasan2 ; Kazi Selim Anwar3; P.K. Rajesh4 ; Gokul Shankar Sabesan 5*

Staphylococcus aureus est l'un des agents pathogènes humains les plus fréquemment isolés, responsables de plusieurs infections, dont la pneumonie infantile. S. aureus développe souvent une résistance à la pénicilline, à la céfoxitine, aux aminoglycosides, aux céphalosporines et/ou aux β-lactamines, mais est appelé « SARM » lorsqu'il devient résistant à l'oxacilline et/ou à la méthicilline. Selon différentes études, S. aureus provoque une pneumonie chez 7 à 44 % des enfants malaisiens, mais le SARM en particulier est responsable de 3 à 5 % des pneumonies communautaires (PC) dans le monde, y compris en Malaisie. Étant donné que les rapports sur l'épidémiologie moléculaire du SARM restent rares chez les enfants malaisiens, cette recherche a comparé les analyses bactériologiques, biochimiques et moléculaires entre le SARM et le MSSA (S. aureus sensible à la méthicilline) isolés à partir d'écouvillons nasopharyngés (NPS) d'enfants atteints de pneumonie. Au total, 220 enfants de moins de 5 ans sélectionnés au hasard et admis dans deux hôpitaux de Kedah, en Malaisie, ont été étudiés. Avec le consentement écrit de la mère/tuteur, les NPS ont été cultivés sur des plaques de gélose au sel de mannitol et au sang. Après une incubation aérobie d'une nuit (35-37 °C), la morphologie des colonies a été lue, la coloration de Gram et les identifications biochimiques (catalase et coagulase positives et fermentation CHO) enregistrées. La sensibilité aux antimicrobiens (AST) a été testée avec AMC20, CRO30, CIP5, E15, CN10, OX1, S10, TE30 et VA30 et les souches de SARM ont été détectées sur la base de la résistance à l'oxacilline. Le diagnostic clinique (par des pédiatres) a révélé 76 % de cas de pneumonie parmi les enfants hospitalisés. Phénotypiquement, S. aureus a été isolé des NPS de 32,6 % des enfants atteints de pneumonie, dont 39,4 % se sont révélés être du SARM. Français Pour l'analyse génotypique, la PCR a été réalisée en utilisant deux amorces spécifiques : femA (S. aureus) et mecA (SARM) et la taille des bandes a été déterminée par électrophorèse sur gel d'agarose. Les résultats de laboratoire montrent moins de prévalence du SARM en utilisant l'identification génotypique (32 %) que celle phénotypique (39 %). Aucune différence n'était évidente entre les méthodes phénotypiques du SARM et du MSSA, sauf dans la méthode moléculaire (p<0,00). Une différence significative a été observée entre la pneumonie et le SARM/MSSA (p<0,04) et avec femA/mecA (p<0,00). Ces observations sur le S. aureus nasopharyngé suggèrent que le MSSA peut également jouer un rôle important en tant que cause potentielle de pneumonie infantile autre que le SARM, dans une faible proportion. La présente étude exige fortement des recherches épidémiologiques moléculaires plus détaillées comparant le rôle du MSSA et du SARM pour élucider leurs diversités génétiques associées à la cause de la pneumonie infantile.